A microbiologia diagnóstica é uma especialidade das ciências que se concentra na aplicação da microbiologia ao diagnóstico médico. Como outros microbiologistas, os microbiologistas de diagnóstico tendem a trabalhar em um ambiente de laboratório que lhes permite acesso a uma variedade de equipamentos que podem usar para identificar e estudar os organismos que encontram. As pessoas nesta área podem trabalhar em laboratórios que realizam testes de diagnóstico para hospitais e clínicas, e também podem trabalhar em pesquisa e desenvolvimento, ajudando a desenvolver novas técnicas de diagnóstico e tratamentos para infecções microbianas.