Limnologia é o estudo das inter-relações estruturais e funcionais de organismos de águas interiores - lagos (de água doce e salina), reservatórios, rios, riachos, pântanos e águas subterrâneas à medida que seus ambientes dinâmicos físicos, químicos e bióticos os afetam.
A disciplina limnológica integra as relações funcionais de crescimento, adaptação, ciclos de nutrientes e produtividade biológica com a composição das espécies, e descreve e avalia como os ambientes físicos, químicos e biológicos regulam essas relações.
A palavra limnologia é derivada do grego limne – pântano, lagoa e do latim limnaea – coisa pertencente a um pântano.
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