A técnica assistida por marcadores, também chamada de melhoramento assistido por marcadores (MAB), evita esse problema ao utilizar marcadores genéticos que estão ligados à característica desejada. Assim que conseguirem identificar uma sequência genética que está sempre ligada à resistência a doenças, eles conseguirão. O MAS pode ser mais eficiente, eficaz e confiável do que a seleção fenotípica. Além disso, o MAS pode reduzir significativamente o tempo de desenvolvimento das variedades, pelo que, em alguns casos, será mais rentável do que a selecção baseada em fenótipos. MAS também permite a criação de características complexas não viáveis através de métodos convencionais anteriores. Embora certamente não seja a solução mágica para todos os problemas, o MAS é uma abordagem promissora para o melhoramento convencional de plantas