O estudo do ambiente natural é conhecido como biotecnologia ambiental. O desenvolvimento, uso e regulamentação de sistemas biológicos para remediação de ambientes contaminados e para processos ecológicos também são conhecidos como biotecnologia ambiental, de acordo com a Sociedade Internacional de Biotecnologia Ambiental. O uso ideal da natureza é chamado de biotecnologia ambiental. Biotecnologia Ambiental, uma subdisciplina da Biotecnologia, é a aplicação da biotecnologia usada para estudar o ambiente natural. É útil no tratamento de águas residuais e na prevenção da poluição. A biotecnologia ambiental é mais eficiente na limpeza de resíduos do que os métodos convencionais. A biorremediação é a aplicação mais ampla empregada por engenheiros ambientais para limpar o meio ambiente. Eles adicionam nutrientes ao solo no local dos resíduos que estimulam a atividade das bactérias ou adicionam novas bactérias ao solo que digerem os resíduos e limpam o local. A biorremediação é uma área interessante da biotecnologia ambiental; suas aplicações são vastas e confiáveis.