A Proteômica Vegetal preocupa-se com todo o complemento de proteínas das plantas, incluindo as modificações feitas em um determinado conjunto de proteínas. A proteômica é um estudo aprofundado de um proteoma específico, incluindo informações sobre proteínas e suas modificações e variações. A Proteômica trabalha com os parceiros de interação e membros associados a ela em uma rede sequencial.