Jornal de Fisiologia e Patologia Vegetal

匙羹藤 (Gymnema sylvestre R.Br.) EST-SSR 标记的开发和验证

Kuldeepsingh A. Kalariya、Lipi Poojara、Dipal Minipara、Parmeshwar Lal Saran、Ram Prasnna Meena、Sinora Macwan、Ponnuchamy Manivel

匙羹藤属于萝藦科，以其抗糖尿病特性而闻名，原产于南印度森林。它也生长在热带非洲和澳大利亚。这种植物的所有地上部分都含有生物碱、黄酮和皂苷，但叶子主要用于药用。据报道，这种植物的多样性基于形态、解剖和化学特征以及随机扩增多态性 DNA (RAPD) 和简单序列重复 (ISSR) 标记，然而，这种植物缺乏通过最有效的表达序列标签-SSR (EST-SSR) 标记在分子水平上进行的遗传多样性。本研究生成了大量转录组数据，并确定了 5276 个 SSR 位点。匙羹藤中的 SSR 频率为 1/12.16 kB。 AAG/CTT 重复次数几乎是 CCG/CGG 重复次数的十倍。共合成了 40 对引物，其中 27 个引物在从印度不同地区采集的 25 种G. sylvestre基因型中产生了多态性扩增。基因型 DGS 16 和 DGS 34 是最不相似的基因型。这是首次利用 EST-SSR 标记揭示G. sylvestre的遗传多样性和高多态性的研究，转移率较高，为 67.5%。报告称，不同簇中相同状态的基因型分布混乱，这可能是因为G. sylvestre是一种重要的药用植物，自古以来人们就一直在使用，据推测它可能会迁移到不同的地方。