Os organismos que causam doenças infecciosas incluem fungos, oomicetos, bactérias, vírus, viróides, organismos semelhantes a vírus, fitoplasmas, protozoários, nematóides e plantas parasitas. Envolve o estudo da identificação de patógenos, etiologia de doenças, impacto econômico dos ciclos de doenças, epidemiologia de doenças de plantas, resistência a doenças de plantas, como as doenças de plantas afetam humanos e animais, genética de patossistemas e manejo de doenças de plantas.