Jornal de Fisiologia e Patologia Vegetal

拟南芥基因组中一系列硝酸盐转运蛋白旁系同源物的阐明

Panchsheela Nogia、Vandana Tomar、Gurpreet Kaur Sidhu、Rajesh Mehrotra 和 Sandhya Mehrotra

植物在小规模复制 (SSD) 和全基因组复制 (WGD) 后都会产生基因旁系同源物。众所周知，植物会保留复制的基因并增强其基因库，这对其基因组的进化有很大的贡献。一般认为，此类旁系同源物在进化过程中既被选择又被保留，因为它们在不同的时间和空间模式下表达不同水平的蛋白质。在拟南芥中，参与信号传导和转录调控的旁系同源物通常在基因和基因组复制事件后保留。我们分析了拟南芥基因组中原始硝酸盐转运蛋白基因 NTR 的复制事件。大多数旁系同源物都具有高亲和力、低亲和力和双亲和力硝酸盐转运蛋白的功能，其中一些受硝酸盐水平本身的调节，并参与各种植物功能，如胚胎发育、抑制侧根起始、气孔开放、木质部和韧皮部运输和伤口反应等。对于目前的分析，从 TAIR 数据库中检索了 19 个硝酸盐转运蛋白序列，并通过网络服务工具 PINDA 和手动分析，得到了类似的结果。发现几种转运蛋白充当旁系同源物，因为它们之间存在密切的序列同源性。结果表明，高等植物中硝酸盐转运蛋白的亚功能化是一系列基因重复事件的结果。