A microbiologia veterinária trata das diversas doenças microbianas (bacterianas, fúngicas, virais) em animais, especialmente aqueles que fornecem alimentos, outros produtos úteis ou companhia. Os estudos de resistência antimicrobiana também estão incluídos nos diversos estudos de microbiologia animal. As doenças microbianas de animais selvagens também são estudadas na microbiologia animal se as infecções forem de especial interesse devido à sua inter-relação com humanos (zoonose) e animais domésticos. Os microbiologistas veterinários são médicos especializados no estudo de microrganismos que causam doenças infecciosas em espécies animais. Estão frequentemente envolvidos no desenvolvimento de vacinas, medicamentos e outros produtos de saúde animal. Os microbiologistas veterinários são responsáveis pelo estudo de uma variedade de microrganismos causadores de doenças, incluindo vírus, bactérias e parasitas. Eles conduzem estudos de pesquisa e publicam os resultados em periódicos revisados por pares.