A determinação da sequência de aminoácidos da proteína, o estudo das mudanças na conformação das proteínas e também o estudo das moléculas complexas com qualquer outra molécula não peptídica é a análise da sequência proteica. Os processos celulares de um organismo vivo são conhecidos pela descoberta da estrutura e função das proteínas, permitindo assim ao pesquisador desenvolver e projetar alvos para medicamentos. A espectrometria de massa e a degradação de Edman são os principais métodos para determinar o sequenciamento de proteínas. Eles têm a principal vantagem de seguir grandes quantidades de proteínas em paralelo, que também são exemplos e reagentes rápidos, mecanizados, práticos, profundamente sensíveis e poupadores. Neste ponto, é uma metodologia promissora com uma ampla variedade de utilizações para exploração experimental e clínica.