Biotechnologię gleby definiuje się jako naukę manipulacji florą mikrobiologiczną gleby i jej aktywnością metaboliczną w celu ochrony i rekultywacji gleby. Jest to powstająca dziedzina biotechnologii, skupiająca się głównie na wykorzystaniu drobnoustrojów glebowych do poprawy właściwości fizycznych gleby, dostępności składników odżywczych dla roślin, degradacji ksenobiotyków i innych odpadów, kontrolowania patogenów roślin przenoszonych przez glebę, poprawy zdrowia roślin i ochrona naturalnego ekosystemu. Identyfikacja i rozwój nowych środków mikrobiologicznych do biologicznego zwalczania szkodników roślin, modyfikacji patogenów roślin w celu zmniejszenia zjadliwości i bioremediacji gleby to rewolucjonizujący aspekt przemysłu biotechnologicznego.